Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nek2O35942 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nek2O35942 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nek2O35942 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms