Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Socs1O35716 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Socs1O35716 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms