Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NudcO35685 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NudcO35685 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NudcO35685 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NudcO35685 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NudcO35685 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NudcO35685 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NudcO35685 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NudcO35685 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NudcO35685 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NudcO35685 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NudcO35685 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NudcO35685 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NudcO35685 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms