Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcc1O35379 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcc1O35379 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms