Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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ColqO35348 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ColqO35348 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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ColqO35348 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ColqO35348 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ColqO35348 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ColqO35348 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ColqO35348 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ColqO35348 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ColqO35348 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ColqO35348 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ColqO35348 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ColqO35348 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ColqO35348 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ColqO35348 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ColqO35348 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ColqO35348 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ColqO35348 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ColqO35348 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ColqO35348 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ColqO35348 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ColqO35348 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ColqO35348 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ColqO35348 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms