Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srsf5O35326 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf5O35326 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms