Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ebi3O35228 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ebi3O35228 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms