Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms