Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ncoa3O09000 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncoa3O09000 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms