Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm2035J3QP87 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm2035J3QP87 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm2035J3QP87 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm2035J3QP87 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm2035J3QP87 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms