Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim18J3QNP2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms