Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3415J3QMS8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3415J3QMS8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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