Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3727J3QM54 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3727J3QM54 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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