Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcf11G3X9Z4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms