Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmgxb3G3X9M3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms