Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Colca2F8VPY8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms