Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc37F8VPK0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc37F8VPK0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms