Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms