Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Crocc2F6XLV1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms