Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5861F6VCN9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5861F6VCN9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms