Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4E9QAP7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms