Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms