Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Simc1E9Q6E9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Simc1E9Q6E9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms