Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms