Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd1E9Q3H4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd1E9Q3H4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms