Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930523C07RikE9Q2T4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930523C07RikE9Q2T4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930523C07RikE9Q2T4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930523C07RikE9Q2T4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930523C07RikE9Q2T4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930523C07RikE9Q2T4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930523C07RikE9Q2T4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms