Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hectd4E9Q2E4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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