Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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