Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms