Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fndc1E9Q043 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc1E9Q043 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms