Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms