Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms