Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3002E9PW72 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms