Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc144bE9PVZ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms