Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim30bE9PVL6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms