Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6904E9PVF1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm6904E9PVF1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm6904E9PVF1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6904E9PVF1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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