Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam53aE9PV82 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms