Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syde2E9PUP1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syde2E9PUP1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms