Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms