Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clca3bE9PUL3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clca3bE9PUL3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms