Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cngb1E1AZ71 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cngb1E1AZ71 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Cngb1E1AZ71 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cngb1E1AZ71 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms