Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms