Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptrhd1D3Z4S3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms