Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hfm1D3Z4R1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hfm1D3Z4R1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms