Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms