Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm3543D3Z235 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm3543D3Z235 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3543D3Z235 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms