Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
3425401B19RikD3Z1D3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms