Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms