Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn24D3YXJ9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn24D3YXJ9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms