Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Rexo5D3YW29 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Rexo5D3YW29 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Rexo5D3YW29 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo5D3YW29 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms